更にもうちょっと

x86はLittleEndianなのでintやshortで比較すると4Byte目の大小から優先されて戻り値の正負がstrncmpと異なりうるという問題が・・・。
Endian変換にはbswap命令を使えばいいわけですが、Cから直接扱う方法を知らないので保留。元々等しいかどうかの確認のために始めたわけだし、と言い訳（ぉ
大小関係を比較するような用途には要注意。

そうは言っても誤用されたりしたら困るので差し替えてみる。
↓昨日最後のもの

int _strncmp(void *buf, void *str, size_t size){
    int *b = (int *)buf;
    int *s = (int *)str;
    unsigned int k = size >> 2;
    for(unsigned int i=0;i<k;i++){
        if( (b[i])^(s[i]) ){ return (b[i] - s[i]); }
    }
    k <<= 1;
    short *sb = (short *)buf;
    short *ss = (short *)str;
    if( (size & 2) && ( (sb[k])^(ss[k]) ) ){ return (sb[k] - ss[k]); }
    k <<= 1;
    char *cb = (char *)buf;
    char *cs = (char *)str;
    if( (size & 1) && ( (cb[k])^(cs[k]) ) ){ return (cb[k] - cs[k]); }
    return 0;
}

↓Endian変換挿入後

int _strncmp(void *buf, void *str, size_t size){
    int *b = (int *)buf;
    int *s = (int *)str;
    unsigned int k = size >> 2;
    for(unsigned int i=0;i<k;i++){
        if( (b[i])^(s[i]) ){ return (ntohl(b[i]) - ntohl(s[i])); }
    }
    k <<= 1;
    short *sb = (short *)buf;
    short *ss = (short *)str;
    if( (size & 2) && ( (sb[k])^(ss[k]) ) ){ return (ntohs(sb[k]) - ntohs(ss[k])); }
    k <<= 1;
    char *cb = (char *)buf;
    char *cs = (char *)str;
    if( (size & 1) && ( (cb[k])^(cs[k]) ) ){ return (cb[k] - cs[k]); }
    return 0;
}

おそらくこれで正しく動作すると思います（未確認（汗

追記：200文字目で異なる場合、50秒対68秒と4割ほど減速。memcmp()よりは早いけど。ntohl()/ntohs()のオーバーヘッドがかなり大きいらしく数文字の比較のみで片が付く場合はmemcmp()にすら惨敗します（汗